La parte más importante del sistema acuaponico casero es el filtro  biológico. El secreto del filtro es muy simple: las bacterias. Para  empezar hay que ver para que es el material del filtro. Las bacterias  que van a desintoxicar el agua se forman sobre toda superficie sólida.  Aunque supongo que hay medios micróscopicos para verlas, la prueba más  fácil es la del tacto: si tocas un plástico, piedra o el mismo  recipiente que tiene agua desde hace varios días, verás que está  cubierto de una película cafesosa y babosa, que contiene las bacterias  del agua. Entonces, esta baba que hace que nos caigamos en los arrollos y  piedras mojadas, mientras más superficie tenga para hacerse, más  cantidad de agua podra limpiar. Las piedras tienen poca superficie  debido a que solo se pueden poner babosas en su superficie; por esto,  mientras más chicas, mejor. 
Los materiales esponjosos como las fibras  tienen suficiente espacio "hueco" dentro de ellas para que se formen  grandes colonias bacterianas.
He leído gran  cantidad de documentos al respecto, de diversos autores con  emprendimientos exitosos. Aunque varían en muchas cosas, todos tienen  algo en común: defienden su material de filtro como a su equipo de  futból. El mismo que unos dicen que no sirve, otros dicen que es la  octava maravilla. Con todo este caudal de opiniones, solo queda lo de  siempre: probar. 
 
Hasta el momento he visto que muchos han  funcionado, a veces tardan más, a veces menos, pero el chiste es que  terminan haciendo lo que tienen que hacer. El que he utilizado yo ha  sido una mezcla de filtro para peceras (no necesitas comprar en los  acuarios, lo puedes conseguir en una tienda de telas por metro, a mi me  dijeron que se llamaba DACRON, pero lo puedes pedir como el que sirve  para rellenar edredones) y fibras para trastes o piso. La razón de esta  mezcla es porque me basé en el filtro SKIPPY (http://www.skippysstuff.com/),  que dice que las fibras son lo máximo. El problema con las fibras es  que, en un contenedor pequeño, no son buen filtro mecánico. Esto es, las  fibras dejan pasar mucha basura por huecos que dejan al llenar el  filtro. La fibra de pecera puesta sobre estos termina con este problema.  
 
Las piedras de tezontle, terminan por "taparse" debido a  las impurezas y el crecimiento de las bacterias; las piedras como la  grava no tienen tanta superficie para las bacterias como otros medios  (no son huecas). De todos modos, en cantidad suficiente, funcionan bien.
La pedacería de PVC, las "BIO-BALLS" y las perlas de plástico no las he probado, pero los BIO-BALLS son el material de batalla en los filtros para peceras marinas y hay mucha documentación acerca del éxito del PVC y las bolitas de plástico.
Ya que todos funcionan  eventualmente, lo mejor es irse por lo que está a la mano. Traerse un  costal de tezontle o grava y lavarlo es bastante pesado, así que me fuí  por el camino fácil que son las fibras. No necesitan ser lo más fino,  vayan a donde hay fibras chafas, de esas que nadie compra porque "se  deshacen a la primer tallada". Como no vamos a tallar con ellas, para  nuestro propósito son buenas. No he visto donde comprarlas al mayoreo,  para lo que compré no hubiera alcanzado el volumen de todos modos.
 
Una  vez que hayamos elegido el material que vamos a usar, hay que usarlo y  dejar que la naturaleza siga su curso. No es necesario meterse con el  filtro para que funcione. De hecho, al hacerlo mataremos gran cantidad  de bacterias y disminuirá su eficiencia. Si nuestro filtro es lo  suficientemente grande para nuestro sistema, no es necesario meterse con  el. Aunque no he visto literatura "oficial" acerca del tamaño, si  tenemos un filtro que sea al menos del 5% del tamaño de nuestro estanque  con eso estaremos bien. En mi caso me fuí por el 10%, más vale pecar de  precavido.

El primer paso es tener un recipiente que vaya a tener todo adentro. Dado que las algas pueden tapar completamente el filtro, es mejor utilizar un recipiente que no deje pasar la luz. El agua deberá entrar desde el fondo hacia arriba, para asegurarnos de que pase por toda la superficie del filtro (fibras y DACRON). Para esto dejaremos un espacio "hueco" en el fondo del recipiente, para que las fibras no tapen la manguera. Para esto podemos utilizar una coladera de esas para verduras, empotrada al fondo del recipiente, como se ve en la foto.
Lo que sigue es simplemente llenarla con las fibras de tallar. Debido a su tamaño y al pequeño tamaño  del filtro, es mejor cortarlas a la mitad para que se acomoden mejor.  Estas fibras deberán cubrir el recipiente hasta sus 3/4 partes. La  manguera es mejor meterla desde ahora para no estar batallando después.  Como el agua debe comenzar a fluir desde el fondo, la manguera va hasta  allá. El flujo ascendente del agua hará que las fibras y el DACRON le  quiten las impurezas que no están disueltas y las colonias de bacterias  que se irán formando en las fibras harán la conversión del amoniaco en  nitratos.
tamaño  del filtro, es mejor cortarlas a la mitad para que se acomoden mejor.  Estas fibras deberán cubrir el recipiente hasta sus 3/4 partes. La  manguera es mejor meterla desde ahora para no estar batallando después.  Como el agua debe comenzar a fluir desde el fondo, la manguera va hasta  allá. El flujo ascendente del agua hará que las fibras y el DACRON le  quiten las impurezas que no están disueltas y las colonias de bacterias  que se irán formando en las fibras harán la conversión del amoniaco en  nitratos.
 

El primer paso es tener un recipiente que vaya a tener todo adentro. Dado que las algas pueden tapar completamente el filtro, es mejor utilizar un recipiente que no deje pasar la luz. El agua deberá entrar desde el fondo hacia arriba, para asegurarnos de que pase por toda la superficie del filtro (fibras y DACRON). Para esto dejaremos un espacio "hueco" en el fondo del recipiente, para que las fibras no tapen la manguera. Para esto podemos utilizar una coladera de esas para verduras, empotrada al fondo del recipiente, como se ve en la foto.
Lo que sigue es simplemente llenarla con las fibras de tallar. Debido a su tamaño y al pequeño
 tamaño  del filtro, es mejor cortarlas a la mitad para que se acomoden mejor.  Estas fibras deberán cubrir el recipiente hasta sus 3/4 partes. La  manguera es mejor meterla desde ahora para no estar batallando después.  Como el agua debe comenzar a fluir desde el fondo, la manguera va hasta  allá. El flujo ascendente del agua hará que las fibras y el DACRON le  quiten las impurezas que no están disueltas y las colonias de bacterias  que se irán formando en las fibras harán la conversión del amoniaco en  nitratos.
tamaño  del filtro, es mejor cortarlas a la mitad para que se acomoden mejor.  Estas fibras deberán cubrir el recipiente hasta sus 3/4 partes. La  manguera es mejor meterla desde ahora para no estar batallando después.  Como el agua debe comenzar a fluir desde el fondo, la manguera va hasta  allá. El flujo ascendente del agua hará que las fibras y el DACRON le  quiten las impurezas que no están disueltas y las colonias de bacterias  que se irán formando en las fibras harán la conversión del amoniaco en  nitratos.Por último, ponemos el  DACRON encima. Nuevamente, el DACRON capturará las basuras que hayan  pasado por los huecos que dejan las fibras en el filtro. En esta parte  pondremos un rebose para que el agua que ya pasó por el filtro, regrese  al estanque con los peces.

El sistema terminado queda de la siguiente manera:

En  hacer este filtro tardé aproximadamente una hora y eso que no me  dediqué por completo. Si tenemos los materiales, este filtro lo podemos  hacer muy rápidamente. Lo único que hay que esperar es a que se seque el  silicón que utilicé para sellar el rebose del filtro (por donde sale el  tubo de PVC). Claro que necesitaras herramientas especializadas con las  siguientes:

Como  podrás ver, hacer un filtro biológico no toma mucho tiempo ni dinero.  Lo más caro de todo es la bomba sumergible, que puede costar desde $10  US hasta $40 US para un sistema pequeño como este. En el caso de la  bomba, yo recomiendo comprar la mejor que puedas pagar. En este momento  el sistema no tiene plantas, pero si queremos generar suficiente presión  y altura para regar un sistema hidropónico, más vale que tengamos el  poder suficiente desde el principio
Por último, hay que  recordar que las bacterias son las que harán todo y hay que esperar a  que se reproduzcan. El filtro no podrá hacer su trabajo hasta que las  colonias de bacterias estén bien establecidas, por lo que hay que  esperar. En la siguiente entrada veremos como se inicia el filtro  biológico y lo que hay que hacer antes de poner seres vivos en el.